日本在正式对德奥宣战后，首先行动的不是陆军而是海军。根据与协约国商定的分工，日本海军将组织南遣舰队，负责保障西太平洋航线的安全并夺取德国在赤道以北的全部岛屿，包括马里亚纳群岛，加罗林群岛，马绍尔群岛，帛琉群岛以及太平洋海底电报的通信中心雅浦岛。为此，日本海军组织了两支南遣舰队，第一南遣舰队在9月12日便南下了。但兵力却原逊于英法的期望，第一南遣舰队由战列巡洋舰鞍马号为旗舰，战列巡洋舰筑波号、装甲巡洋舰浅间号、第16驱逐舰队2艘驱逐舰以及运输舰南海丸、远江丸组成。在日本发动对华战争时，第二南遣舰队尚在编成中。
但日本海军主力并未将肃清德国海外殖民地当做第一要务，主力投入到了侵华战争中。至9月15日中日谈判尚未破裂之前，日本海军已将主力编为三个舰队，其中第一舰队由加藤友三郎中将指挥，负责黄海方面哨戒并保护通航。计有战列舰2艘摄津、安艺，轻巡洋舰2艘笠置、音羽以及5艘驱逐舰组成的三支驱逐舰队。
第二舰队负责青岛攻略，由加藤定吉中将指挥，计有4艘战列舰周防、石见、河内、丹后，3艘装甲巡洋舰磐手、八云、常磐、2艘轻巡洋舰千岁、千代田、海防舰2艘冲岛、见岛，水上飞机母舰若宫丸。驱逐舰8艘以及5艘大型运输舰。
为了遏制孱弱的中国海军，日本还组织了第三舰队，负责东中国海方面哨戒，任务是封锁并相机歼灭以上海、广州为基地的中国海军，该舰队由土屋光吉少将指挥，编有战列舰2艘摄津、石见战列巡洋舰2艘金刚、比睿，轻巡洋舰3艘新高、秋津州、利根，海防舰春日、日进，以及9艘驱逐舰和5艘炮舰。
相比于陆军，日本根本没有将中国海军放在眼里。的确。比起亚洲第一、世界第四的日本海军。中国海军实在是太弱小了。
以日本海军的实力，完全可以攻入长江中国腹地。根据日本掌握的情报，中国在吴淞口及长江沿岸并未修筑大型江防炮台，但海军军令部给第三舰队的兵力却仅够封锁上海中国海军。这就有些意思了。俄国对日本的海上威胁已经解除。日本在西太平洋几无敌手。如果彻底消灭中国那几万吨军舰，有什么必要组建以哨戒黄海保证通航的第一舰队？海军是进攻型军种，被动防御注定要吃败仗的。日本人这样排兵布阵。既有外部的因素，更主要的是内部因素。
外部原因之一是因为英法强烈禁止日本攻入长江中国腹地以挑起与中国的全面战争。英法担心中国做出过激的反应，就此将中国逼入同盟国阵营，青岛之战后这种情绪尤为强烈。内部因素呢，日本并不准备与中国全面开战，既因财政之困扰，拿不出钱来打一场灭国之战，也因为没有把握。更重要的是他们获知了中国海军拥有两个潜艇编队，拥有20艘以上的进口潜艇，军令部担心舰队的反潜能力不足，如果被中国潜艇击沉大型军舰就是笑话了，所以才编组了以护航为目的的第一舰队和以封锁为目的的第三舰队。日本对中国的海上战略就是封锁，将中国海军堵在港口内就行。
跟阵容豪华的日本海军相比，中国海军就很寒酸了。有些乞丐跟龙王斗宝的感觉。
新中华成立后，全面接管了满清留下的海军遗产，海军以上海、福建、广东为三大基地，对于渤海湾和黄海反而放弃了。这是无奈之举。山东拥有漫长的海岸线，但由于德国和英国舰队的存在，几无中国海军的立足之地，渤海湾自旅顺丢失后，这片中国内海反而没有中国海军的活动空间。于是将基地设于南方，缓慢地积蓄力量，以待时机。
龙谦定都北京的第二个月便组建了海军司令部，以他老资格的总参谋长、山东军司令官方时俊出任海军总司令。龙谦为海军发展确定了“培养人才、积蓄力量、等待-->>