后来他连柯南的档案都会连带做处理了。
只是这次他假死，有一段时间在休养和做准备，爱尔兰正好卡在这个时间点去帝丹小学查看。
灰原哀的不对劲倒是没被发现，但柯南的不对劲被他发现了——在组织待过的雪莉对待自己的痕迹还是更小心的。
爱尔兰没能得到决定性证据，但他已经能够推测出，柯南就是工藤新一了。
而这时，柯南也将连环杀人案推理到了最后的真相阶段。
在东京塔里，被“安排”成为最后凶手的人，和真正的凶手对峙了。他们都是为了一个死在一场火灾里的女孩而痛苦着，一个想要赎罪，一个想要复仇。
一直关注着案件进度的琴酒，已经从仓库里将直升飞机开了出来。
而时刻关注爱尔兰进度的贝尔摩德，也积攒了足够的杀心：她知道爱尔兰发现了柯南的身份，甚至一直在爱尔兰身边，美其名曰“保护易容”，实际上紧跟警方进度。
爱尔兰则在破案的过程中逐渐被工藤新一的聪慧折服。
他原本只想将工藤新一当做琴酒的把柄，但在他抢到记忆卡，却被开着直升飞机的琴酒毫不留情 “灭口”后，他反而在濒危时硬是护住了工藤新一。
他没有将工藤新一的身份说开，而是保护了工藤新一，并且告诉工藤新一：你是破坏掉组织的希望。他甚至明白了自己为什么会落到这个地步，于是他说：“难怪贝尔摩德会这么看重你……”
但是，如果我落入这样的境地，是因为贝尔摩德和琴酒合作的话，那么，一直被认为对组织无比忠诚毫无私心的琴酒，原来……原来……
真是太好笑了。他忍不住想笑，却瞳孔涣散，最后失去了意识。
琴酒的直升飞机没能成功飞走，中途被一颗足球攻击。琴酒千钧一发时机自己握住了飞机的操纵杆，成功让飞机降落了。他想起了突然出现的那颗足球……那个被那么多人护着的小孩，倒确实有点别的本事。
他想起了上次伏特加错误理解了板仓卓的信息。那时候他当然发现了柯南，但在那之前不管是柯南还是贝尔摩德都表现出想要保护这个小孩的模样，所以他放了人一马。
或许那时候他已经无意中做出选择。
最后飞机坠毁，琴酒本人和带着的人都没什么事。琴酒看着面前的残骸，给后勤组拍了照。他没什么心理负担：反正用过了他就开心了。战损本来也不是他负责。
夜晚，从警方那里得知，没有查到假扮松本清长的人的身份长相的柯南，忍不住想起了说出那番话的爱尔兰。
他忍了忍，最后旁敲侧击问了问父亲：赤井先生最近的状态如何。
他已经意识到，赤井那里知道的组织情报一定比雪莉多。
“那家伙当初可是行动组的风云人物。”灰原哀在得知柯南和赤井合作以后曾说过这番话，“他和玛格丽特表面敌对实际兄妹同心，而玛格丽特是琴酒的下属，那这不就说明他那几年对组织的行动几乎了然于心吗”
“不过，能不能让他开口说出情报，就看你的了。”雪莉说，“至少姐姐的事，他没有告诉FBI。”
这也是雪莉信任赤井的理由之一。
当然，这几天，在知道了“赤井秀一被琴酒杀死”后，雪莉一直是“假的吧又是假死”这种态度。-->>